实用肿瘤杂志

2022, (02) 163-169,170

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结肠腺癌免疫预后基因的开发与验证
Development and verifi cation of immune prognostic genes in colon adenocarcinoma

向瑶1;2;周伟弘3;王桃丽2;王俊普1;3

摘要(Abstract):

目的 发掘结肠腺癌(colon adenocarcinoma,COAD)免疫预后标志物并精准预测COAD生存风险。方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载COAD患者的临床信息以及RNA-seq数据,获取差异的免疫相关基因(differential immune related gene,DEIRG)。利用单变量和多变量Cox比例风险回归模型鉴定具有预后价值的免疫基因构建模型。利用Kaplan-Meier法分析模型中高风险和低风险患者的生存状态,并使用受试者操作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估该风险评分模型的准确度,并且从样本中随机抽取70%的病例作内部验证。采用单因素和多因素Cox回归分析,确定COAD的独立预后因素。结果 利用单因素和多因素Cox比例风险回归分析确定载脂蛋白12(lipocalin 12,LCN12)、嗜铬素A(chromogranin A,CHGA)、抑制素β亚基(inhibin subunit beta B,INHBB)、R3H域包含像(R3H domain containinglike,R3HDML)和黑皮质素1受体(melanocortin 1 receptor,MC1R)为COAD患者预后风险模型中的5个风险基因(均P<0.05),对该模型进行风险评分,高风险组患者总生存时间较低风险组短(P=0.007),在随机抽取的内部测试组中得到验证,高风险组患者预后较低风险组差(P=0.028)。风险评分预测1年和3年总生存的ROC曲线下面积(area under curve,AUC)为0.715和0.683,内部验证组ROC AUC分别为0.736和0.673。单因素和多因素Cox分析显示,在实验组及内部验证组中风险评分是COAD的独立预后因素(P<0.01)。结论 开发并验证的COAD免疫预后基因LCN12CHGAINHBBR3HDMLMC1R可提高COAD筛查及诊断效率,并对鉴定高或低生存风险的COAD患者亚组的治疗具有意义。

关键词(KeyWords): 结肠腺癌;免疫预后基因;风险评分

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation):

作者(Authors): 向瑶1;2;周伟弘3;王桃丽2;王俊普1;3

DOI: 10.13267/j.cnki.syzlzz.2022.026

参考文献(References):

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